できます。
しかしながら、ユーザープロフィール1つのキー名に対して、それぞれの方法で更新を行ってしまうと、順番によっては意図せぬ挙動が発生することがあります。
- アプリに実装したSDKからユーザープロフィールを更新する
- ユーザープロフィールバルクインポートAPIを利用しユーザープロフィールを更新する
ユーザープロフィールバルクインポートAPIなどAPIでデータを更新した後に、アプリからユーザープロフィールが設定されると、アプリ側の値にて再度ユーザーのプロフィールデータが更新されます。
APIで更新をするユーザープロフィールは、基本的にアプリ側では設定ができないユーザープロフィールを更新するよう運用してください。