プッシュ通知の配信数は端末単位
オーディエンスの対象ユーザー数はユーザーID単位※

での集計となり、定義が異なっております。
こちらが原因でプッシュ通知の配信数よりオーディエンスの対象ユーザー数のほうが多くなる可能性があります。

※ユーザIDの定義はこちらご参照ください
http://docs.repro.io/ja/dev/sdk/user-id.html

例えば会員ID等をユーザIDでセットしており、
1つの会員IDで2つの端末にアクセスしている場合だと、

プッシュ通知の配信数=2
オーディエンスの対象ユーザー数=1

となりプッシュ通知の配信数の方が多くなります。

逆に1端末で複数会員IDでログインするケースですと、
オーディエンスの対象ユーザ数の方が多くなることも考えられます。

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